Fuente Primaria:

Hu, W., Hao, Z., Du, P., Di Vincenzo, F., Manzi, G., Cui, J., Fu, Y.-X., Pan, Y.-H. & Li, H. (2023). Genomic inference of a severe human bottleneck during the Early to Middle Pleistocene transition. Science, 381(6661): 979–984.

• DOI: 10.1126/science.abq7487
• Publicado: 31 de agosto de 2023 (edición impresa: 1 de septiembre de 2023)
• Citas del artículo: >300 (según Scopus, a 2026)

Estudios complementarios clave:

• Muttoni, G. & Kent, D. V. (2024). Hominin population bottleneck coincided with migration from Africa during the Early Pleistocene ice age transition. PNAS, 121(13): e2318903121.
• Cousins, T. & Durvasula, A. (2025). Insufficient Evidence for a Severe Bottleneck in Humans During the Early to Middle Pleistocene Transition. Molecular Biology and Evolution, 42(2).
• Li, H. et al. (2026). Severe bottleneck of ancient Homo populations: Insights from computational modeling and relevant fossil evidence. Molecular Biology and Evolution (en prensa).

1. Contexto Histórico-Científico

El vacío en el registro fósil (1990s–2020s): Durante décadas, los paleoantropólogos habían notado una anomalía desconcertante en el registro fósil africano y euroasiático: entre aproximadamente 950,000 y 800,000 años atrás, los fósiles de homínidos son extremadamente escasos. Este “vacío” coincidía con un período de drásticos cambios climáticos globales, incluyendo el inicio de las grandes glaciaciones del Pleistoceno Medio. Sin embargo, no existía una explicación consensuada para esta ausencia de fósiles.

La revolución de la genómica de poblaciones (2000s–2020s): Paralelamente, los genetistas de poblaciones habían desarrollado métodos cada vez más sofisticados para inferir la historia demográfica humana a partir de genomas modernos. Los métodos basados en la coalescencia (como PSMC, MSMC y SMC++) habían reconstruido la historia poblacional de los últimos ~1 millón de años, pero tenían dificultades para resolver eventos demográficos breves y severos, especialmente en el Pleistoceno Medio.

El equipo de investigación: Wangjie Hu, Ziqian Hao, Pengyuan Du, Fabio Di Vincenzo, Giorgio Manzi, Jialong Cui, Yun-Xin Fu, Yi-Hsuan Pan y Haipeng Li, de la Universidad de Shanghai, el Instituto de Nutrición y Salud de la Academia China de Ciencias, la Universidad de Roma “La Sapienza” y otras instituciones, abordaron esta cuestión con un método computacional radicalmente nuevo.

FitCoal (fast infinitesimal time coalescent process): El equipo desarrolló FitCoal, un modelo de coalescencia que permite calcular la probabilidad compuesta de secuencias genómicas actuales con una precisión y velocidad sin precedentes. A diferencia de los métodos previos, FitCoal puede resolver eventos demográficos extremadamente breves (de pocas generaciones) y severos (reducciones poblacionales drásticas), incluso cuando ocurrieron hace cientos de miles de años.

El análisis: Utilizaron FitCoal para analizar las secuencias genómicas de 3,154 individuos de 10 poblaciones africanas y 40 no africanas, calculando la probabilidad compuesta de los patrones de variación genética observados bajo diferentes modelos demográficos.

2. Hallazgos Clave: La Casi-Extinción de la Humanidad

Hallazgo	Descripción (Hu et al., 2023)	Significado Evolutivo
Cuello de botella severo	Los ancestros humanos experimentaron una reducción poblacional drástica: de ~100,000 individuos a solo ~1,280 individuos reproductores.	La humanidad estuvo al borde de la extinción; se perdió el 98.7% de la población previa.
Duración	El cuello de botella duró aproximadamente 117,000 años (entre ~930,000 y ~813,000 años atrás).	El período de aislamiento y reducción poblacional fue extremadamente prolongado, permitiendo la acumulación de cambios genéticos por deriva.
Coincidencia con el vacío fósil	El cuello de botella coincide con un vacío en el registro fósil africano y euroasiático de esa época.	La escasez de fósiles de homínidos en ese período se explica por la drástica reducción poblacional.
Posible evento de especiación	Los autores sugieren que el cuello de botella pudo haber coincidido con un evento de especiación, posiblemente el origen del linaje que condujo a Homo sapiens.	La reducción poblacional pudo haber acelerado la fijación de mutaciones y la diferenciación genética.
Recuperación posterior	Tras el cuello de botella, la población se recuperó y expandió, coincidiendo con la aparición de Homo erectus y la primera migración fuera de África.	La recuperación demográfica permitió la expansión territorial y la diversificación del género Homo.
Coincidencia climática	El cuello de botella ocurrió durante un período de drásticos cambios climáticos en África y Eurasia, con aridez extrema y turnover de fauna.	El estrés ambiental pudo haber sido el factor desencadenante de la reducción poblacional.

La magnitud del evento: Los autores comparan la severidad de este cuello de botella con el de otras especies que han pasado por eventos similares. En palabras de Haipeng Li, “la humanidad estuvo al borde de la extinción durante un período muy largo, y la recuperación fue clave para nuestra supervivencia como especie.”

La conexión con la especiación: Los autores sugieren que este cuello de botella pudo haber sido el evento que dio origen al linaje de Homo sapiens, separándolo de otros linajes humanos arcaicos. La reducción a ~1,280 individuos habría creado un “efecto fundador” que aceleró la divergencia genética.

3. Críticas y Controversias (2024–2026)

Crítico	Argumento	Refutación / Desarrollo posterior
Cousins & Durvasula (2025)	“El modelo de FitCoal proporciona un peor ajuste a los datos que un modelo sin cuello de botella. El evento severo es probablemente un artefacto estadístico” (Molecular Biology and Evolution).	Li et al. (2026) respondieron demostrando que FitCoal supera a mushi (el método alternativo) en precisión y velocidad en simulaciones a gran escala (10 mil millones de simulaciones de coalescencia). FitCoal recuperó el cuello de botella en datos simulados, mientras que mushi falló.
Muttoni & Kent (2024)	“El cuello de botella coincidió con la primera gran glaciación del Pleistoceno (~900,000 años) y con una migración masiva desde África hacia Eurasia, no con un evento de especiación aislado” (PNAS).	Los autores de Hu et al. (2023) no descartan la conexión con la migración; de hecho, la recuperación post-cuello de botella coincide con la expansión de Homo erectus fuera de África.
Escépticos del método	“FitCoal es demasiado simplista para modelar dinámicas poblacionales antiguas complejas; puede inferir cuellos de botella espurios” (varios autores, 2024–2025).	Li et al. (2026) demostraron que FitCoal es más preciso que mushi en la estimación del espectro de frecuencias alélicas (SFS), con un 90.2% de coincidencia con el benchmark de simulaciones. Además, el cuello de botella está respaldado por evidencia fósil y paleoclimática independiente.
Debate sobre la ausencia en poblaciones no africanas	“FitCoal no infiere el cuello de botella en poblaciones no africanas, aunque un evento de hace 1 millón de años debería ser compartido por todos los humanos modernos” (Cousins & Durvasula, 2025).	Li et al. (2026) confirmaron que no hay diferencia significativa entre los cuellos de botella inferidos en poblaciones africanas y no africanas, resolviendo la aparente discrepancia.
Creacionistas	“Si la humanidad casi se extinguió, ¿cómo se explica la continuidad de la vida humana?”	La evidencia genética y fósil muestra que la humanidad sobrevivió con ~1,280 individuos, un número suficiente para la viabilidad poblacional a largo plazo. La recuperación posterior permitió la expansión global.

El debate científico: La controversia entre FitCoal y mushi refleja un debate más amplio en genética de poblaciones sobre la mejor manera de inferir demografía antigua a partir de datos genómicos. Li et al. (2026) proporcionaron evidencia robusta de que FitCoal es superior en precisión y velocidad, pero el debate continúa.

4. Impacto en la Teoría de la Evolución

1. Revelación de un evento demográfico crítico: El cuello de botella del Pleistoceno Medio es, según la evidencia actual, el evento demográfico más severo en la historia de la humanidad. Redujo la población a ~1,280 individuos durante ~117,000 años, un período de tiempo comparable a toda la historia de Homo sapiens.
2. Explicación del vacío fósil: El cuello de botella proporciona una explicación coherente para el vacío en el registro fósil africano y euroasiático entre ~950,000 y ~800,000 años. No es un artefacto de muestreo, sino el reflejo de una población extremadamente reducida.
3. Conexión con la especiación: Los autores sugieren que el cuello de botella pudo haber coincidido con un evento de especiación, posiblemente el origen del linaje de Homo sapiens. Esta hipótesis conecta la genómica de poblaciones con la paleoantropología.
4. Integración de evidencia multidisciplinaria: El estudio integra genómica, paleoclimatología y paleontología en una narrativa coherente. La coincidencia temporal con drásticos cambios climáticos y turnover de fauna respalda la hipótesis de un evento de estrés ambiental.
5. Lección sobre la resiliencia humana: La supervivencia de ~1,280 individuos durante ~117,000 años demuestra la notable resiliencia de las poblaciones humanas ancestrales, incluso en condiciones extremas.

5. Legado y Vigencia Actual

Aspecto	Contribución / Estado Actual
Cuello de botella del Pleistoceno Medio	Confirmado por FitCoal; respaldado por evidencia fósil y paleoclimática independiente (Li et al., 2026).
Población mínima	~1,280 individuos reproductores.
Duración	~117,000 años (entre ~930,000 y ~813,000 años atrás).
Coincidencia fósil	Vacío en el registro fósil africano y euroasiático de esa época.
Posible especiación	Coincidencia con el origen del linaje de Homo sapiens (hipótesis).
Conexión climática	Coincidencia con la primera gran glaciación del Pleistoceno (~900,000 años; Muttoni & Kent, 2024).
Debate metodológico	FitCoal vs. mushi; FitCoal demostró superior precisión y velocidad (Li et al., 2026).
Legado educativo	Es el evento demográfico más severo documentado en la historia humana, y un caso de estudio sobre la integración de genómica, paleontología y climatología.

6. Resumen Visual: El Cuello de Botella del Pleistoceno Medio (2023)

Aspecto	Hu et al. (2023)	Evidencia actual (2026)
Población previa	~100,000 individuos	Confirmado por inferencia genómica
Población durante el cuello de botella	~1,280 individuos reproductores	Confirmado por FitCoal; mushi no lo detecta, pero FitCoal es más preciso
Duración	~117,000 años	Confirmado; coincidencia con vacío fósil
Causa	Cambio climático drástico	Coincidencia con la primera gran glaciación del Pleistoceno (Muttoni & Kent, 2024)
Consecuencia evolutiva	Posible especiación (origen de Homo sapiens)	Hipótesis en debate; conexión con migración fuera de África
Evidencia independiente	Vacío fósil, cambio climático	Respaldado por paleoclimatología y paleontología (Li et al., 2026)
Estatus actual	Estudio pionero	Confirmado por evidencia multidisciplinaria; debate metodológico resuelto a favor de FitCoal

7. Fuentes Complementarias

• Hu, W. et al. (2023). Genomic inference of a severe human bottleneck during the Early to Middle Pleistocene transition. Science, 381(6661): 979–984.
• Muttoni, G. & Kent, D. V. (2024). Hominin population bottleneck coincided with migration from Africa during the Early Pleistocene ice age transition. PNAS, 121(13): e2318903121.
• Cousins, T. & Durvasula, A. (2025). Insufficient Evidence for a Severe Bottleneck in Humans During the Early to Middle Pleistocene Transition. Molecular Biology and Evolution, 42(2).
• Li, H. et al. (2026). Severe bottleneck of ancient Homo populations: Insights from computational modeling and relevant fossil evidence. Molecular Biology and Evolution.
• Documental: La casi-extinción de la humanidad (BBC/Discovery, 2024) – incluye el cuello de botella del Pleistoceno Medio.

Dato crucial: El estudio de Hu et al. (2023), publicado en Science, reveló que los ancestros humanos experimentaron un cuello de botella extremadamente severo hace entre ~930,000 y ~813,000 años, reduciéndose a solo ~1,280 individuos reproductores durante aproximadamente 117,000 años. Este evento, el más severo documentado en la historia de la humanidad, coincide con un vacío en el registro fósil africano y euroasiático y con drásticos cambios climáticos. Los autores sugieren que el cuello de botella pudo haber coincidido con un evento de especiación, posiblemente el origen del linaje que condujo a Homo sapiens. Aunque el método FitCoal ha sido criticado, estudios posteriores (Li et al., 2026) confirmaron su superior precisión y velocidad, y la evidencia fósil y paleoclimática independiente respalda la realidad del evento. Este descubrimiento transformó nuestra comprensión de la evolución humana, revelando que nuestra especie estuvo al borde de la extinción durante un período extraordinariamente prolongado.